به طور کلی از تمام قسمت های یک گیاه برای استفاده در کشت بافت استفاده کرد. ریز نمونه ممکن است قطعاتی از برگ، ساقه، ریشه، مریستم انتهایی ساقه یا ریشه، میوه های کوچک، غنچه های گل یا مادگی و حتی یک سلول یا پروتوپلاست یک سلول باشد. از کشت هر یک از این قسمت ها ممکن است بافتی به نام کالوس به وجود آید، که این بافت از تعداد زیادی سلولهای غیر تخصصی تشکیل شده است. این بافت از تقسیم سلولی، سلولهای بافت کشت شده بدست می آید. از بافت کالوس در ریز ازدیادی و کشت بافت بسیار استفاده می شود و با ایجاد شرایط مناسب از آن گیاه کامل بدست می آورند، یا ممکن است از قطعه یا اندام کشت شده مستقیما به شاخه زایی رسید، و بعد از آن شاخه ها را به گیاه کامل تبدیل کرد.